Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brca1P48754 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brca1P48754 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brca1P48754 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brca1P48754 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brca1P48754 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brca1P48754 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brca1P48754 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brca1P48754 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brca1P48754 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brca1P48754 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Brca1P48754 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brca1P48754 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brca1P48754 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brca1P48754 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca1P48754 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca1P48754 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Brca1P48754 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Brca1P48754 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms