Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prox1P48437 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Prox1P48437 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Prox1P48437 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prox1P48437 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prox1P48437 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prox1P48437 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Prox1P48437 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prox1P48437 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Prox1P48437 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 185.7 ms