Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcd1P48410 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcd1P48410 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcd1P48410 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms