Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfx2P48379 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rfx2P48379 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfx2P48379 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms