Protein–RNA interactions for Protein: P47741

Tnfrsf4, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf4P47741 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tnfrsf4P47741 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf4P47741 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf4P47741 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms