Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11bP46638 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11bP46638 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11bP46638 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms