Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sdc2P43407 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sdc2P43407 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sdc2P43407 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms