Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ItgavP43406 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgavP43406 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ItgavP43406 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgavP43406 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ItgavP43406 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ItgavP43406 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgavP43406 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgavP43406 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ItgavP43406 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgavP43406 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ItgavP43406 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms