Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tlx1P43345 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlx1P43345 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlx1P43345 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tlx1P43345 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlx1P43345 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tlx1P43345 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tlx1P43345 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tlx1P43345 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tlx1P43345 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlx1P43345 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms