Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HttP42859 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HttP42859 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HttP42859 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HttP42859 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HttP42859 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HttP42859 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HttP42859 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HttP42859 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HttP42859 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HttP42859 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HttP42859 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HttP42859 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HttP42859 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HttP42859 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HttP42859 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HttP42859 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HttP42859 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HttP42859 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HttP42859 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HttP42859 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HttP42859 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HttP42859 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HttP42859 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HttP42859 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HttP42859 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HttP42859 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HttP42859 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HttP42859 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HttP42859 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HttP42859 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HttP42859 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HttP42859 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HttP42859 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HttP42859 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HttP42859 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HttP42859 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HttP42859 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HttP42859 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HttP42859 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HttP42859 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HttP42859 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HttP42859 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HttP42859 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HttP42859 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HttP42859 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HttP42859 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HttP42859 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HttP42859 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HttP42859 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HttP42859 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HttP42859 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HttP42859 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HttP42859 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HttP42859 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HttP42859 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HttP42859 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HttP42859 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HttP42859 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HttP42859 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HttP42859 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HttP42859 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HttP42859 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HttP42859 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HttP42859 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HttP42859 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HttP42859 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HttP42859 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HttP42859 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HttP42859 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HttP42859 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HttP42859 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HttP42859 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HttP42859 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HttP42859 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HttP42859 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HttP42859 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HttP42859 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HttP42859 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HttP42859 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HttP42859 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HttP42859 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HttP42859 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HttP42859 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HttP42859 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HttP42859 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HttP42859 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HttP42859 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HttP42859 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HttP42859 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HttP42859 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HttP42859 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HttP42859 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HttP42859 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HttP42859 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HttP42859 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HttP42859 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HttP42859 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HttP42859 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HttP42859 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms