Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sept1P42209 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sept1P42209 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sept1P42209 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sept1P42209 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sept1P42209 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sept1P42209 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sept1P42209 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept1P42209 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sept1P42209 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sept1P42209 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sept1P42209 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms