Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnfsf9P41274 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tnfsf9P41274 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfsf9P41274 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfsf9P41274 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tnfsf9P41274 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf9P41274 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tnfsf9P41274 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms