Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Etv1P41164 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Etv1P41164 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Etv1P41164 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Etv1P41164 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Etv1P41164 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Etv1P41164 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Etv1P41164 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Etv1P41164 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms