Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ThpoP40226 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ThpoP40226 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ThpoP40226 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ThpoP40226 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ThpoP40226 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ThpoP40226 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ThpoP40226 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ThpoP40226 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms