Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TtlP38585 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TtlP38585 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TtlP38585 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TtlP38585 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TtlP38585 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TtlP38585 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TtlP38585 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TtlP38585 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TtlP38585 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TtlP38585 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TtlP38585 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TtlP38585 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TtlP38585 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TtlP38585 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TtlP38585 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TtlP38585 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TtlP38585 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TtlP38585 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TtlP38585 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TtlP38585 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TtlP38585 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TtlP38585 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TtlP38585 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TtlP38585 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TtlP38585 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TtlP38585 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TtlP38585 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TtlP38585 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TtlP38585 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TtlP38585 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TtlP38585 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TtlP38585 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TtlP38585 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TtlP38585 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TtlP38585 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TtlP38585 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TtlP38585 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TtlP38585 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TtlP38585 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TtlP38585 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TtlP38585 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TtlP38585 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TtlP38585 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TtlP38585 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TtlP38585 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TtlP38585 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TtlP38585 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TtlP38585 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TtlP38585 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TtlP38585 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TtlP38585 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TtlP38585 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TtlP38585 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TtlP38585 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TtlP38585 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TtlP38585 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TtlP38585 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TtlP38585 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TtlP38585 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TtlP38585 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TtlP38585 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TtlP38585 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TtlP38585 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TtlP38585 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TtlP38585 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TtlP38585 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TtlP38585 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TtlP38585 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TtlP38585 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TtlP38585 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TtlP38585 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TtlP38585 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TtlP38585 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TtlP38585 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TtlP38585 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TtlP38585 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TtlP38585 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TtlP38585 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TtlP38585 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TtlP38585 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TtlP38585 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TtlP38585 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TtlP38585 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TtlP38585 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TtlP38585 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TtlP38585 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TtlP38585 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.4 ms