Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lig1P37913 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig1P37913 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lig1P37913 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig1P37913 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lig1P37913 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lig1P37913 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lig1P37913 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lig1P37913 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lig1P37913 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lig1P37913 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Lig1P37913 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lig1P37913 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lig1P37913 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lig1P37913 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lig1P37913 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lig1P37913 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lig1P37913 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms