Protein–RNA interactions for Protein: P36423

Tbxas1, Thromboxane-A synthase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbxas1P36423 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tbxas1P36423 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tbxas1P36423 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbxas1P36423 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbxas1P36423 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbxas1P36423 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbxas1P36423 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbxas1P36423 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbxas1P36423 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbxas1P36423 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms