Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ddit3P35639 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ddit3P35639 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ddit3P35639 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ddit3P35639 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms