Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc1P35601 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rfc1P35601 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rfc1P35601 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms