Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grin1P35438 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grin1P35438 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin1P35438 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin1P35438 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin1P35438 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Grin1P35438 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Grin1P35438 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin1P35438 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Grin1P35438 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms