Protein–RNA interactions for Protein: P35329

Cd22, B-cell receptor CD22, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd22P35329 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd22P35329 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cd22P35329 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd22P35329 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd22P35329 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cd22P35329 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd22P35329 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd22P35329 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cd22P35329 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd22P35329 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cd22P35329 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms