Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PvalbP32848 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PvalbP32848 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PvalbP32848 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PvalbP32848 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PvalbP32848 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PvalbP32848 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PvalbP32848 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PvalbP32848 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PvalbP32848 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PvalbP32848 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PvalbP32848 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PvalbP32848 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PvalbP32848 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PvalbP32848 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms