Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cd28P31041 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd28P31041 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd28P31041 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd28P31041 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cd28P31041 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd28P31041 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd28P31041 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd28P31041 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd28P31041 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd28P31041 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd28P31041 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms