Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnga1P29974 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cnga1P29974 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnga1P29974 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnga1P29974 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms