Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dusp1P28563 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dusp1P28563 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dusp1P28563 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms