Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxd9P28357 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.77■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxd9P28357 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hoxd9P28357 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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