Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apex1P28352 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apex1P28352 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apex1P28352 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apex1P28352 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apex1P28352 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apex1P28352 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apex1P28352 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apex1P28352 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Apex1P28352 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apex1P28352 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apex1P28352 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apex1P28352 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apex1P28352 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Apex1P28352 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Apex1P28352 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apex1P28352 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apex1P28352 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apex1P28352 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apex1P28352 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apex1P28352 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apex1P28352 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Apex1P28352 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms