Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LoxP28301 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LoxP28301 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LoxP28301 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LoxP28301 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LoxP28301 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LoxP28301 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LoxP28301 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LoxP28301 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LoxP28301 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LoxP28301 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LoxP28301 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LoxP28301 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LoxP28301 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LoxP28301 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LoxP28301 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LoxP28301 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LoxP28301 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LoxP28301 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LoxP28301 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LoxP28301 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LoxP28301 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LoxP28301 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
LoxP28301 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LoxP28301 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LoxP28301 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LoxP28301 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LoxP28301 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LoxP28301 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LoxP28301 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LoxP28301 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LoxP28301 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LoxP28301 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LoxP28301 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LoxP28301 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LoxP28301 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LoxP28301 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LoxP28301 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LoxP28301 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LoxP28301 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LoxP28301 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LoxP28301 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LoxP28301 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LoxP28301 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LoxP28301 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LoxP28301 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LoxP28301 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LoxP28301 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LoxP28301 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LoxP28301 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LoxP28301 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LoxP28301 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LoxP28301 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LoxP28301 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LoxP28301 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LoxP28301 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LoxP28301 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LoxP28301 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LoxP28301 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LoxP28301 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LoxP28301 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LoxP28301 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LoxP28301 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LoxP28301 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LoxP28301 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LoxP28301 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LoxP28301 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LoxP28301 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LoxP28301 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LoxP28301 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LoxP28301 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LoxP28301 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LoxP28301 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms