Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja4P28235 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gja4P28235 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja4P28235 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja4P28235 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gja4P28235 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja4P28235 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja4P28235 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja4P28235 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja4P28235 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gja4P28235 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gja4P28235 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja4P28235 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja4P28235 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja4P28235 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja4P28235 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gja4P28235 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms