Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb3P28231 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gjb3P28231 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gjb3P28231 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms