Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-DMaP28078 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-DMaP28078 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms