Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
U2af2P26369 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af2P26369 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
U2af2P26369 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af2P26369 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af2P26369 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af2P26369 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af2P26369 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
U2af2P26369 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms