Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Aldh1a1P24549 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Aldh1a1P24549 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Aldh1a1P24549 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms