Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mdm2P23804 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mdm2P23804 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Mdm2P23804 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Mdm2P23804 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms