Protein–RNA interactions for Protein: P23772

Gata3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata3P23772 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata3P23772 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata3P23772 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata3P23772 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata3P23772 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata3P23772 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gata3P23772 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata3P23772 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata3P23772 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata3P23772 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata3P23772 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata3P23772 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gata3P23772 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms