Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NfyaP23708 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfyaP23708 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfyaP23708 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NfyaP23708 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NfyaP23708 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfyaP23708 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NfyaP23708 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms