Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf8P23611 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf8P23611 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Irf8P23611 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf8P23611 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irf8P23611 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf8P23611 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irf8P23611 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf8P23611 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf8P23611 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf8P23611 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf8P23611 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irf8P23611 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irf8P23611 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms