Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ms4a2P20490 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ms4a2P20490 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ms4a2P20490 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms