Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ntf3P20181 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ntf3P20181 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms