Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VimP20152 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VimP20152 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VimP20152 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VimP20152 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VimP20152 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VimP20152 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VimP20152 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VimP20152 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VimP20152 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VimP20152 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VimP20152 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VimP20152 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VimP20152 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VimP20152 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VimP20152 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VimP20152 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VimP20152 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VimP20152 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VimP20152 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VimP20152 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VimP20152 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VimP20152 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VimP20152 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VimP20152 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VimP20152 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VimP20152 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VimP20152 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VimP20152 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VimP20152 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VimP20152 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VimP20152 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VimP20152 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VimP20152 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VimP20152 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VimP20152 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
VimP20152 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VimP20152 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VimP20152 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VimP20152 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VimP20152 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VimP20152 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VimP20152 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VimP20152 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VimP20152 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VimP20152 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VimP20152 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VimP20152 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VimP20152 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VimP20152 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VimP20152 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VimP20152 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VimP20152 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VimP20152 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VimP20152 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VimP20152 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VimP20152 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VimP20152 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VimP20152 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VimP20152 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VimP20152 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VimP20152 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VimP20152 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VimP20152 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VimP20152 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VimP20152 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VimP20152 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VimP20152 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VimP20152 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VimP20152 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VimP20152 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VimP20152 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VimP20152 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VimP20152 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VimP20152 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VimP20152 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VimP20152 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VimP20152 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VimP20152 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VimP20152 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VimP20152 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VimP20152 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VimP20152 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VimP20152 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VimP20152 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VimP20152 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VimP20152 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VimP20152 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VimP20152 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VimP20152 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VimP20152 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VimP20152 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VimP20152 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VimP20152 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VimP20152 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VimP20152 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VimP20152 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VimP20152 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VimP20152 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VimP20152 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms