Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lsp1P19973 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lsp1P19973 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lsp1P19973 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms