Protein–RNA interactions for Protein: P16092

Fgfr1, Fibroblast growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1P16092 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fgfr1P16092 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1P16092 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr1P16092 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms