Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkceP16054 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkceP16054 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkceP16054 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkceP16054 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkceP16054 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkceP16054 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkceP16054 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkceP16054 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkceP16054 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkceP16054 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkceP16054 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkceP16054 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PrkceP16054 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.1 ms