Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Vpreb2P13373 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Vpreb2P13373 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Vpreb2P13373 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms