Protein–RNA interactions for Protein: P11942

Cd3g, T-cell surface glycoprotein CD3 gamma chain, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3gP11942 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd3gP11942 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd3gP11942 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd3gP11942 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd3gP11942 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cd3gP11942 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cd3gP11942 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms