Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp1P11103 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp1P11103 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Parp1P11103 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Parp1P11103 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Parp1P11103 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Parp1P11103 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp1P11103 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp1P11103 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp1P11103 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp1P11103 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Parp1P11103 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Parp1P11103 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms