Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col1a1P11087 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a1P11087 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Col1a1P11087 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 404.8 ms