Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxc6P10629 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxc6P10629 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc6P10629 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms