Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxd4P10628 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxd4P10628 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxd4P10628 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms