Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PolP10400 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PolP10400 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PolP10400 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PolP10400 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PolP10400 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PolP10400 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PolP10400 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PolP10400 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PolP10400 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PolP10400 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PolP10400 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PolP10400 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PolP10400 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PolP10400 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolP10400 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolP10400 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolP10400 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolP10400 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolP10400 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolP10400 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolP10400 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PolP10400 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PolP10400 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PolP10400 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PolP10400 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PolP10400 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP10400 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP10400 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP10400 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP10400 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PolP10400 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PolP10400 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolP10400 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolP10400 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PolP10400 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP10400 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PolP10400 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PolP10400 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PolP10400 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PolP10400 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP10400 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP10400 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PolP10400 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP10400 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP10400 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PolP10400 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PolP10400 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP10400 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PolP10400 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP10400 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP10400 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PolP10400 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP10400 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PolP10400 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP10400 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
PolP10400 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP10400 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP10400 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PolP10400 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PolP10400 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP10400 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP10400 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP10400 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP10400 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP10400 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PolP10400 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP10400 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PolP10400 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PolP10400 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms